Аптека во 2-й ГКБ выполняет чрезвычайно важную функцию. От профессиональной, слаженной работы службы зависит своевременное обеспечение пациентов больницы всеми необходимыми лекарственными средствами, товарами аптечного ассортимента, изделиями медицинского назначения. 

Работа аптеки регулируется Законом Республики Беларусь от 20.07.2006г. № 161-3 «О лекарственных средствах» (Изменения и дополнения от 05.08.2008г.) и Законом Республики Беларусь от 15.06.2009г. №27-3 «О внесении изменений и дополнений в некоторые законы республики Беларусь по вопросам обращения лекарств». 

Основной задачей аптеки является обеспечение стационара УЗ “2-я городская клиническая больница” лекарственными средствами и изделиями медицинского назначения.

Исходя из основных задач, аптека выполняет следующие функции:

• Изготовление экстемпоральных лекарственных форм;
• Обеспечение готовыми лекарственными средствами и изделиями медицинского назначения;
• Выдача лекарственных средств и изделий медицинского назначения структурным подразделениям больницы